抗日战争胜利后，浙江大学于1946年9月迁回浙江杭州，此后湄潭文庙被用作县参议会办公室和民教馆。中华人民共和国建立后辟为县图书馆，20世纪50年代后用作县干部宿舍和档案馆至1985年。鉴于湄潭文庙所具有的价值，1982年2月，贵州省人民政府公布其为省级文物保护单位，并于1984年进行了维修，1990年7月建成“浙大西迁历史陈列馆”。1996年，对文庙大成殿进行重点维修，2000-2002年，对文庙再次维修。2006年，湄潭浙江大学旧址被国务院核定公布为第六批全国重点文物保护单位，湄潭文庙是其重要组成部分。
2010年，湄潭县文体广播电视旅游局委托贵州省文物保护研究中心编制《湄潭浙江大学旧址——文庙修缮工程设计方案》，2011年，国家文物局下达《关于湄潭浙江大学旧址——文庙修缮工程设计方案的批复》（文物保函[2011]629号）。2012年6月26日，由贵州弘筑园林古建装饰工程有限公司承担施工、贵州省文物保护研究中心承担监理的湄潭浙江大学旧址——文庙修缮工程开工，2013年9月28日竣工，2014年1月6日通过贵州省文物局组织的竣工验收，工程质量合格。
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