中国医学科学院阜外医院始建于1956年，是一所集医疗、科研、预防和人才培养于一体的三级专科医院，是北京市医保定点单位。 2021年8月，中国医学科学院阜外医院实验诊断中心被评选为第20届全国青年文明号。 2021年11月20日，入选2020年度中国医院综合排行榜。 2021年12月3日，门头沟区政府与中国医学科学院阜外医院签署战略合作框架协议，共同推动首批国家医学中心阜外西山院区落地门头沟。