1 绪论
1.1 研究背景
1.2 基因表达数据挖掘
1.3 基因表达数据挖掘研究现状概述
1.3.1 基于定量测度的双聚类
1.3.2 基于定性测度的双聚类
1.3.3 基于查询的双聚类
1.3.4 约束型双聚类
1.3.5 存在的问题
1.4 主要工作
1.5 组织结构
2 基因表达数据中的局部模式挖掘研究综述
2.1 引言
2.2 问题定义
2.3 局部模式类型与标准
2.4 研究现状
2.4.1 基于定量测度的双聚类
2.4.2 基于定性测度的双聚类
2.4.3 基于查询的双聚类
2.4.4 约束型双聚类
2.4.5 存在的问题
2.5 未来研究方向
2.6 小结
3 基于蝶形网络的基因表达数据并行分割与挖掘方法
3.1 引言
3.2 问题定义与分析
3.2.1 问题定义
3.2.2 优缺点分析
3.3 并行分割方法
3.3.1 基于蝶形网络的HamaBSP框架
3.3.2 基于分布式哈希表的去冗余方法
3.3.3 结果完整性的证明
3.4 实验评估
3.4.1 分布式并行方法与单机实现的比较
3.4.2 分布式并行框架的比较
3.5 相关工作
3.6 小结
……
4 OPSM的索引与查询
5 OMEGA:OPSM的挖掘、索引与查询工具
6 基因表达数据中OPSM的约束查询
7 基于数字签名与Trie的OPSM约束查询
8 总结与展望
参考文献
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