第一卷 序例上（略）

第二卷 序例下（略）

第三卷 百病用于药上（略）

第四卷 百病用于药下（略）

第五卷 水部（略）

第六卷 火部（略）

第七卷 土部
白垩 2
燕窠土 2
乌爹泥（儿茶） 2
伏龙肝 3
百草霜 3

第八卷 金石部一
金石之一　金类 4
自然铜 4
铜青 4
铅 4
密陀僧 5
锡 5
铁落 5
铁锈 6
金石之二　玉类 6
玉 6
珊瑚 6
马脑（玛瑙） 7
云母 7
白石英 7
紫石英 8

第九卷 金石部二
金石之三　石类上 9
朱砂 9
灵砂 9
雄黄 10
雌黄 10
石膏 10
方解石 11
滑石 11
五色石脂 11
炉甘石 12
无名异 12
石钟乳 12
石灰 13
浮石 13

第十卷 金石部三
金石之四　石类下 14
阳起石 14
慈石（磁石） 14
代赭石 14
禹余粮 15
空青 15
绿青 15
扁青 16
石胆 16
礞石 16
花乳石 17
姜石 17
麦饭石 17
石燕 18
蛇黄 18

第十一卷 金石部四
金石之五　卤石类 19
食盐 19
戎盐 19
凝水石 19
朴消 20
玄明粉 20
硇砂 20
硼砂 21
石硫黄 21
矾石 21
绿矾 22

第十二卷 草部一
草之一　山草类上 23
甘草 23
黄耆（黄芪） 23
人参 24
沙参 24
荠苨 25
桔梗 25
黄精 26
萎蕤（玉竹） 26
肉苁蓉 27
知母 27
苍术 28
列当 28
锁阳 29
赤箭、天麻 29
白术 30
狗脊 30
贯众 31
巴戟天 31
远志 32
百脉根 32
淫羊藿 33
仙茅 33
玄参 34
地榆 34
丹参 35
紫草 35
白头翁 36
白及 36
三七 37

第十三卷 草部二
草之二　山草类下 38
黄连 38
胡黄连 38
黄芩 39
秦艽 39
茈胡（柴胡） 40
前胡 40
防风 41
独活 41
升麻 42
苦参 42
白鲜 43
延胡索 43
贝母 44
山慈姑 44
石蒜 45
水仙 45
白茅 46
地筋 46
芒 47
龙胆 47
细辛 48
杜衡 48
及己 49
鬼督邮 49
徐长卿 49
白薇 50
白前 50
钗子股 51
朱砂根 51
紫金牛 52
拳参 52

第十四卷 草部三
草之三　芳草类 53
当归 53
芎（川芎） 53
蛇床 54
藁本 54
蜘蛛香 55
白芷 55
芍药 56
牡丹 56
木香 57
甘松香 57
山柰 58
山姜 58
高良姜 59
红豆蔻 59
豆蔻 60
白豆蔻 60
缩砂蔤（砂仁） 61
益智子 61
荜茇 62
蒟酱 62
肉豆蔻 63
补骨脂 63
姜黄 64
郁金 64
蓬莪荗（莪术） 65
荆三棱 65
荆三棱—黑三棱 66
莎草、香附子 66
瑞香 67
茉莉 67
郁金香 68
茅香 68
迷迭香 69
艾纳香 69
藿香 70
薰草、零陵香 70
兰草（佩兰） 71
泽兰 71
马兰 72
香薷 72
石香葇（石香薷） 73
爵床 73
赤车使者 74
假苏（荆芥） 74
薄荷 75
积雪草 75
苏（紫苏） 76
荏（白苏） 76
水苏 77

第十五卷 草部四
草之四　隰草类上 78
菊 78
野菊 78
庵 79
蓍 79
艾 80
茵陈蒿 80
青蒿 81
白蒿 81
角蒿 82
马先蒿 82
阴地蕨 83
牡蒿 83
茺蔚（益母草） 84
錾菜 84
夏枯草 85
刘寄奴草 85
曲节草 86
旋覆花 86
青葙 87
鸡冠 87
红蓝花（红花） 88
番红花 88
大蓟 89
小蓟 89
续断 90
苦芺 90
漏卢（漏芦） 91
飞廉 91
苎麻 92
苘麻 92
大青 93