1979年《环境保护法（试行）》实施以来，作为原农业部开展农业环境污染事故调查处理的技术支撑力量，农业农村部环境保护科研监测所组织或独立开展了大量的司法鉴定技术研究与鉴定业务。2005年，在研究所基础上成立了农业生态环境及农产品质量安全司法鉴定中心，至2018年，研究所（司法鉴定中心）独立处理或组织处理的农业环境污染事故或突发污染事件达300余起，受理并完成了60余项鉴定业务。本着“以鉴促研，鉴研并举”的思路，40年来，研究所在农业环境损害鉴定研究和实践方面均取得了较大成绩，起草了近30项相关国家标准和行业标准，出版了《农业生态环境及农产品质量安全司法鉴定专论》《农业环境污染事故诊断技术指南》等10部学术著作，系统梳理了20余起典型鉴定案例，积累了大量鉴定研究成果和实践经验。
　　为了加快推进环境损害司法鉴定工作，提高鉴定人员及相关人员的操作能力，中心计划以种植业、渔业、畜牧业、农用地土壤为受害对象，出台系列操作实务，有效衔接科学研究与鉴定实务，注重操作性和实践性，规范司法鉴定业务流程，使司法鉴定工作者一看就懂、一学就会，帮助鉴定人员快速掌握鉴定知识与技巧，开展鉴定业务。

第1章 受理
1．1 鉴案登记
1．2 鉴案审查
1．2．1 委托登记
1．2．2 审查
1．3 鉴案受理
1．3．1 案情预判
1．3．2 受理决议
1．3．3 报价与协商
1．3．4 鉴定委托书签订

第2章 鉴定与评估
2．1 前期准备
2．1．1 鉴定目标
2．1．2 鉴定依据
2．1．3 人员安排
2．1．4 材料准备
2．1．5 进度安排
2．2 现场调查
2．2．1 调查方法
2．2．2 调查对象及内容
2．2．3 调查结论
2．3 鉴定采样
2．3．1 采样方案
2．3．2 农作物样品采集
2．3．3 土壤样品采集
2．3．4 水体样品采集
2．3．5 大气样品采集
2．3．6 质量控制
2．3．7 样品检测分析
2．4 因果关系分析
2．4．1 判定依据
2．4．2 分析思路
2．4．3 判定流程
2．4．4 判定方法
2．4．5 分析过程
2．4．6 鉴定意见表达
2．5 损害评估
2．5．1 评估内容
2．5．2 评估方法
2．5．3 评估程序
2．6 鉴定意见书编写

第3章 质量控制与内部管理
3．1 质量控制
3．1．1 鉴定原则
3．1．2 全程质控
3．2 来访接待
3．3 报告意见和解释

第4章 案例
附录 农业环境污染损害司法鉴定相关技术规范
附录1 SF/ZJD0601001-2014农业环境污染事故司法鉴定经济损失估算实施规范
附录2 SF/ZJD0606001-2018农业环境污染损害司法鉴定操作技术规范
附录3 SF/ZJD0606002-2018农作物污染司法鉴定调查技术规范
附录4 NY/T3025-2016农业环境污染损害鉴定技术导则