出现在月球上的“黑色巨人”阿梅勒斯投射出朗基努斯之枪，将地球“束缚住”，仿佛在宣告世界的终结。地球遭受着**未有的灾难。在如此混乱的局面中，“班长”洞木光驾驶着白色二号机“欧洲二型EVA”挡在真嗣和超级EVA面前。
在各种势力的意图交错之中，真嗣与绫波、探求异变原因奔赴月球的明日香、探寻Seele足迹的加持和剑介、被No.卡朵儿掳走的美里，他们抵达的地方究竟是何处？
本书将TV版动画《新世纪福音战士》第二十四集作为分歧点，呈现出该故事的另一种可能性，剧情历经十年在此复苏。
真嗣再次看向手边操作台上的屏幕，上面的影像与指挥部中的人们看到的一样。他看着初号机视角下的EVA二号机，还有它的双翼。
“它有着第二代标准的束缚装甲，以及刚刚投入使用的亚莱格丽卡式双翼。这显然不是当初建造EVA时拥有的技术，很明显，当前日本NERV的最高级技术情报泄露了。”
日光透过阴沉的云层缝隙投射到空中的白色EVA身上，使它显得更加洁白耀眼，就像画一样——没错，就和真嗣上美术课时，高画质档案播放的宗教画一样。
这架EVA二号机看起来仿佛在和云层一起运动，并从云层中出现——有可能吗？在它现身之前，雷达没有丝毫反应……
“冬二！它的驾驶员……是班长！”真嗣跳过报告流程，向必须知晓情况的朋友说道。
“怎么可能？”
真嗣听到了冬二惊慌失措的声音，也难怪他会这样。
“可是……”真嗣现在与超级EVA共享心脏，被放大的感知能力让他对自己的直觉深信不疑。
直觉告诉他那就是洞木同学。
这是一种古怪的感觉，其中同时包含了让他怀念和使他反感的部分。二号机、光，以及奔向月球杳无音讯的明日香都浮现在他的脑海中。
那么，反感的部分是从何而来？有什么东西破坏了那架白色EVA二号机的协调感。真嗣从那架白色二号机的肩部支柱位置感觉到了黑色的气息……
“阿梅勒斯的鳞片！”
咚！超级EVA的心脏颤了一下。
——难道它和卡朵儿的0.0EVA出现了同样的问题吗？
卡朵儿的0.0EVA之所以暴走，是因为植入了天使载体尸体的动力源——QR徽章（量子共鸣徽章）。天使载体尸体之所以被超级EVA的心跳声吸引，或许正因为植入QR徽章的它们是尸体。超级EVA察觉到阿梅勒斯的鳞片，也就是QR徽章的气息，马上紧张了起来。
咚！超级EVA的心跳已经乱了，就连与超级EVA一体的真嗣都难以控制。
眼前的白色二号机上就有QR徽章，这让超级EVA——初号机的紧张感迅速转化为攻击冲动。真嗣控制着超级EVA，向对方问道：“班长，你被QR徽章控制了吗？”
白色二号机笔直地举起了十字枪。
“正相反……德国NERV通过技术手段，控制了黑色巨人的量子共鸣板。”
说着，白色二号机把十字枪伸向前，那似乎是前进的信号。
白色巨人的身后传来低沉的轰鸣声和成百架涡轮发动机的声音，无数飞机穿透云层而来，成群结队地从超级EVA的头顶依次飞过。
“这……这是怎么回事？”
惊讶之下，超级EVA巨大的躯体向后退了几步。真嗣无法理解自己看到的情景，超级EVA只是站在那里看着眼前这一幕。
“这是派来的灾害救助队吗？”灾害救助队怎么可能带着战斗机过来？
——他们去哪里？是去南方，他们朝本州飞走了。
……
第一章 海啸
第二章 最后的Seele
第三章 扭曲的庭园
第四章 月影中的明日香
第五章 翻滚的天极
第六章 黑色思维
第七章 Somewhere in Time
第八章 方舟
第九章 在封闭的环中
第十章 黑与紫
第十一章 插曲
第十二章 二号机的呼唤
第十三章 反抗者
后记
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