（二）具体研究方法
1.面板门槛模型计量研究方法
本研究运用面板门槛模型计量研究方法实证探讨了隐性交易费用与工业企业运营效率间的非线性关系。同时，本研究运用面板门槛模型计量研究方法实证分析了不同类型政府交易费用与公共服务绩效间的非线性关系。
2.面板分位数计量研究方法
面板数据分位数模型可以考察自变量对因变量整个条件分布的影响。面板分位数计量研究方法并不严格限定样本数据服从正态分布，同时可以避免数据受到离群值的影响。本研究运用面板数据分位数模型实证分析了不同类型企业显性交易费用对企业经营绩效在不同分位点的边际影响。同时，本研究运用面板数据分位数模型实证分析了内生性交易费用对工业企业经营绩效影响的动态轨迹。在其他部分的实证分析中，本研究也运用了面板分位数计量研究方法。
3.空间面板计量研究方法
本研究运用空间面板计量研究方法实证探讨了隐性交易费用对实体经济绩效影响的空间溢出效应。与省域单元相比，相近城市之间联系更加紧密，因此不可忽视潜在空间相关性。由于各城市在地理环境、技术水平、经济状况方面存在差异，因此传统的空间同质性假设不再适用于解释隐性交易费用与实体经济绩效之间的复杂关系。为了更精确地反映实际，应从空间异质性的角度考察隐性交易费用与实体经济绩效间的空间联系。LeSage和Pace（2009）指出在空间滞后项回归系数不为零的情况下，解释变量估计系数并不能准确反映其对因变量的影响。本研究参考LeSage和Pace提出的偏微分法将解释变量对实体经济绩效的影响效应分解为两部分：一是直接效应，表示本区域隐性交易费用对本地实体经济绩效的影响；二是间接效应（溢出效应），即本区域隐性交易费用对相邻地区实体经济绩效的影响。
4.合成控制计量研究方法
在具体政府交易费用增长的效应评估部分，本研究借助现代计量方法进行间接评估。合成控制法是现代计量研究方法中评价制度型公共品供给效益的新方法。Abadie等（2003）通过对DID方法进行改进，提出利用合成控制法对制度型公共品供给效益进行评估。合成控制法是根据同期没有进行某种制度型公共品供给的其他区域的加权组合来构造对照组，而权重是根据数据特征来决定的。与DID方法相比，合成控制法主要解决了如何寻找相似对照组的难题。
5.面板VAR计量研究方法
向量自回归模型（VAR）是常用的基于时间序列数据的实证分析方法，然而其无法对面板数据进行实证探讨。面板VAR计量研究方法是基于VAR模型的面板数据实证分析方法，其由Holtz-Eakin（1988）提出。相比于VAR模型，面板VAR模型具有更强的稳健性。面板VAR计量研究方法适用于探讨多个变量之间的相互影响效应。在第七章第二节，本研究采用面板VAR计量研究方法从实证视角分析了三层次交易费用的相互影响效应。
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