李祖基，福建莆田人，1952年出生，退休前在厦门大学台湾研究院任教。着有《近代台湾对外贸易研究》《战后台湾四十年》《台湾历史研究》《史海撷英：台湾历史研究续编》《社会转型、抗击外侮与近代化建设——晚清台湾历史映像（1840-1895）》（合着），主编《台湾研究25年精粹，历史篇》《台湾研究新跨越，历史研究》，参与编撰《中国农民负担史》《台湾历史纲要》《福建移民史》等，发掘整理出版了《台湾志略》《巡台录》《蓉洲诗文稿选辑》《东宁政事集》《行间纪遇·清威略将军昊英事略》及《二，二八事件报刊资料汇编》等台湾珍稀文献资料，并在海峡两岸学术刊物上发表关于台湾史的研究论文数十篇。
　　
　　陈忠纯，1980年生，福建省南安市人，历史学博士。现为厦门大学台湾研究院教授、硕士生导师，历史研究所所长，两岸关系和平发展恊同创新中心创新团队成员。1997-2007年在北京师范大学历史系（学院）学习，先后师从史革新教授与郑师渠教授攻读硕士、博士学位。2017-2018年，赴美国德州大学奥斯汀分校历史系及东亚研究中心访学。主要研究方向为台湾史、中国近现代思想文化史。曾在《近代史研究》《中共党史研究》《台湾研究集刊》《福建论坛》《北京师范大学学报》《厦门大学学报》《台湾史研究》（台北）等核心刊物上发表20多篇学术论文，部分论文被《新华文摘》《高等学校文科学术文摘》以及人大复印资料《历史学》《明清史》《中国近代史》全文或论点转载；出版专着2部；曾主持及参与数个国家及教育部科研项目。

　　1.《清代巡台御史奏折汇编》收集北京中国历史档案馆、台北故官博物院以及台北“中央研究院”历史语言研究所等单位典藏的自康熙六十一年至乾隆四十七年间历任巡台御史的相关奏摺。
　　2.部分任满巡台御史奏摺有涉及台湾者，亦酌予收入。
　　3.另外，与巡台御史制度及巡台御史个人有直接关系的上谕和其他大臣的奏摺以附录一的形式附在巡台御史的奏摺之后，以便读者查阅。
　　4.首任巡台御史黄叔着有《南征记程》一卷，以日记的形式详细记录了自京师出发至台湾任所的路缝及沿途见闻，始于康熙后壬寅正月，而迄于是年六月，对于我们了解当年巡台御史自京赴台的路綫与艰辛过程有不少帮助，作为附录二，附在书后。
　　5.巡台御史奏摺按其奏文末尾标注的上奏时间依序排列。部分奏摺上奏时间缺损，只有朱批时间，就依朱批时间排列，并用括弧注明。如“乾隆九年八月初三日（朱批）”。
　　6.个别奏摺既无上奏时间，又无朱批时间，但可按相关的资料推测出时间的，就标注出推测的时间，并用括弧注明。如“乾隆八年四月初六日（推测）”。
　　7.奏摺中原来表示敬意的抬头顶格、空格等格式一律取消，按目前正常书写格式排版，并加上现代汉语的标点。标点的目的主要是为了断句，使读者可以准确理解和把握奏摺原文的意思，并使之更适合于现代的阅读习惯，而非令原来没有标点符号的古代文献来适应当今的汉语规范和格式。
　　8.奏摺原文无分段，现根据奏摺原文的内容，适当予以分段，以便阅读。

　　《清代巡台御史奏折汇编》：
　　巡视台湾监察御史臣索琳谨奏，为剿抚生番，以保民命事。
　　雍正四年十一月初二日，道臣吴昌祚自省回任，带接督臣高其倬谘文一角，内开为凶番戕杀民命，特委台厦道吴副使为总统，兼委淡水同知王肝、北路营参将何勉、淡水守备钟日升等带兵分路进剿，专委以知州管彰化县事知县张缟办运军粮等因到臣。
　　本月十六日，道臣吴昌祚等调领官兵、番壮，自府治先发，臣于十八日选带丁役十二名，自备行粮，亦从臣署起行。至二十六日入牛相触番境，渡阿勃泉溪而抵竹脚藔，与道臣吴昌祚官兵会剳于虎尾溪阳，预令曾历番地之社丁林三招水沙连内决里社土官阿龙等十八名来归，询明路径，又令社丁陈蒲同决里社顺番先至北港蛤里难等社晓谕能归化者，即免诛戮去后。臣与道臣吴昌祚随拨同知臣王淠领熟番三百名，并同知臣王沂自募民壮一百五十名，由北港南投崎抄人番巢之后，候令进发。仍调参将臣何勉、千总吕奕、把总王提带兵二百名联络接应。一拨守备臣钟日升、把总游金阙带兵二百名、熟番三百名，由南港水沙连之前路竹脚蔡候令进发；仍拨千总蔡彬、把总庄子俊带兵一百名、熟番五十名尾后接应；一拨守备臣杨钤带兵一百名，驻剳于凶番之戚属朴仔篱社傍，以岘动静；仍拨把总任林五带兵五十名驻剳于邻近朴仔篱之猫雾拣社，以备应援。
　　臣与道臣吴昌祚率守备臣张文耀，干总傅云章，台湾府经历左懋源，诸罗县革职留任典史赵大章，功加朱绍雄、张厚、林天成、张世俊、许绩、张俊、黄恩，效力外委王廷桂等，统兵一百八十名、民壮一百名、熟番二百八十名，由南港竹脚藔进督。臣查自竹脚藔以至水沙连之中港，路虽百有余里，而其间深溪叠阻，加以崇山峻岭，密箐深林，军粮实难运载，除运粮官彰化县知县臣张缟派拨熟番负十日兵粮随行，仍陆续运济外，臣与道臣吴昌祚躬率官弁、兵役各再身裹五日口粮，徒步进发。前后两路官兵统令十二月初三日进攻，期于水沙连内中港水里社会合。仍拨千总刘弘量带兵弹压彰化县治，并留把总陈士祥、郑捷，效力外委阮邦贵领兵八十名驻守竹脚藔营盘，令台湾县县丞马麟趾散给兵粮。
　　惟是水沙连一带共计二十五社，非尽凶番，今此调兵进剿，原止令其献出杀人凶番，正罪示惩，是以预戒官军，所经之社，顺者抚之，抗者剿之。既体圣主好生，复昭朝廷大法，违者分别参处。遂进督官军渡虎尾溪上游，入内牛相触山口渡溪，至稷稷社旧基安营。初四日渡稷稷溪，历滂雨澜石子滩，渡武滑纳溪，而至武滑纳埔安营。是日守备钟日升遣把总游金阙带到社仔社番滕可宗，招引中港麻思丹社土官田仔率番来归，并愿随军招抚附近番社，随经给赏。初五日，即令其前导渡溪，至外麻里板溪，而越麻里岭北安营。初六日，又渡溪，而至陈武峨安营。初七日，至内里麻溪，而抵外北甲之决里社安营。随据决里社土官阿龙带领毛翠社土官卑猎同番壮来归，当经给赏，令回本社。初八日，据田仔社土官新来田带领中港猫兰社、伊力社二社土官并番壮来归，口称番等不敢作歹，而时常行凶焚杀者系水里社骨宗等语，并愿前导。臣等见外北甲险要，系水沙连前路关隘，官军过后，倘为番党据守，则南港一路军粮不能运济矣，遂留兵壮一百名，令诸罗县革职留任典史赵大章领守，并接散兵粮。初九日，臣等统军带土官新来田等向中港进发，有山前阻，岭高势削，林密如织，其地素无霜雪，草木常青，纵火不燃。臣与道臣吴昌祚鼓舞率众，攀缘开路，穷日之力，始至水里社之中南岸剳营。
　　总计一路所经，迎顺番社则有社仔社、决里社、麻思丹社、毛翠社、伊力社、猫兰社等七社，其望风归附者则有木扣社、大基猫丹社、木武郡社、紫黑社、佛子希社，哆洛社、蛮兰社等七社，惟骨宗一社抗未来归。臣等远望水里社，背山枕湖，左右峻岭廻抱，湖面宽约十里，深不可涉，土番向以大木丈余刳空乘渡，名曰“蟒甲”。臣等令人于茂草中搜得其桨棹，遂于十一日直抵骨宗巢穴。番众初犹恃险，及至官兵一到，枪炮声作，俱惊窜岭北。
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清代巡台御史制度研究（代前言）
雍正朝
1．雍正元年五月二十日
巡台御史吴达礼等奏请台湾诸罗县北增设一县摺
2．雍正元年八月初六日
巡台御史吴达礼等纠参台湾府同知杨毓健失职摺
3．雍正元年十一月十六日
巡台御史黄叔奏请圣安摺
4．雍正二年闰四月二十一日
巡台御史禅济布等奏谢天恩并报接任日期摺
5．雍正二年闰四月二十五日
巡台御史禅济布等奏贺大捷摺
6．雍正二年六月四日
巡台御史禅济布等奏报琉球番船飘泊入境摺
7．雍正二年六月十五日
巡台御史禅济布等奏报雨水田禾地方情形摺
8．雍正二年八月初四日
巡台御史禅济布奏报飓风情形摺
9．雍正二年八月二十四日
巡台御史禅济布等奏陈台湾营伍管见摺
10．雍正二年八月二十四日
巡台御史禅济布等奏报生番接踵归化摺
11．雍正二年十一月初八日
巡台御史禅济布等奏报收成粮价摺
12．雍正二年十二月初一日
巡台御史禅济布等奏报生番归化日众摺
13．雍正三年二月二十日
巡台御史禅济布奏报御史丁士一卸任日期摺
14．雍正三年三月十六日
巡台御史禅济布奏报得雨日期摺
15．雍正三年三月十六日
巡台御史禅济布奏报圣德广布生番归化日众摺
16．雍正三年三月十六日
巡台御史禅济布奏陈建筑木栅情由摺
17．雍正三年五月初四日
巡台御史景考祥奏报到任日期摺
18．雍正三年五月初四日
巡台御史景考祥奏为敬宣敕旨据实回奏摺
19．雍正三年五月初四日
巡台御史禅济布奏谢天恩摺
20．雍正三年五月二十五日（推测）
巡台御史景考祥奏陈闽省盐政之弊摺
21．雍正三年五月二十五日
巡台御史景考祥奏陈海疆情形摺
22．雍正三年五月二十五日
巡台御史景考祥奏陈闻见实据仰邀天鉴摺
23．雍正三年五月二十五日
巡台御史景考祥奏请圣安摺
24．雍正三年九月初九日
巡台御史景考祥奏谢授吏科给事中摺
25．雍正三年九月初九日
巡台御史禅济布等奏请圣安摺
……
乾隆朝
附录
附录二