表观遗传作为与基因组序列无关的基因组功能调控重要途径，是后基因组时代生命科学的研究热点。本书内容包括表观遗传学概念的历史演变、组蛋白的进化、DNA和组蛋白修饰的写入器／擦除器／阅读器的种类／功能／结构、组蛋白变体的种类／结构／功能、多梳蛋白和Trithorax家族蛋白的功能、核小体重塑复合体组成和功能、非编码RNA种类／生物合成／功能、三维基因组学的研究方法与功能，以及不同生物体包括动物、植物、酵母、脉胞菌、纤毛虫、线虫、果蝇的表观遗传学以及特殊组织细胞包括多能干细胞、免疫细胞、癌细胞的表观遗传学。 本书既可以作为表观遗传学领域的入门读物，又可以作为人类、动物、植物、昆虫和微生物等专业科研人员的理论基础读物。另外，本书还适合作为本科生和研究生的教学参考书。

第1章 表观遗传学简史
1.1 引言
1.2 来自遗传学和发育生物学的线索
1.3 DNA在一个生物体的所有体细胞中都是相同的
1.4 DNA甲基化的作用
1.5 染色质的作用
1.6 所有机制都是相互关联的
致谢
第2章 下一代：年轻科学家在表观遗传学研究中令人振奋的新发现
2.1 组蛋白去甲基化酶的发现
2.2 细胞重编程
2.3 lncRNA：将RNA与染色质相连接
2.4 增强子RNA：一类在增强子处合成的长链非编码RNA
致谢
2.5 表观遗传学拓展：基因组DNA中胞嘧啶的新修饰
2.6 植物可移动小.RNA
2.7 CpG岛染色质是通过CxxC类锌指蛋白的招募而形成的
2.8 用于癌症治疗的布罗莫结构域和超末端结构域抑制剂：染色质结构的化学调节
2.9 含布罗莫结构域蛋白在炎症反应中的药理抑制作用
2.10 儿童脑瘤中的组蛋白H3突变
2.11 染色体折叠是表观遗传状态的“驾驶员”还是“乘客”？
致谢
第3章 概述和概念
3.1 遗传学与表观遗传学
3.2 研究表观遗传学的模型系统
3.3 表观遗传学的定义
3.4 染色质模板
3.5 组蛋白修饰：写入器和擦除器
3.6 组蛋白阅读器和染色质重塑因子
3.7 组蛋白变体
3.8 组蛋白修饰的生物学效应
3.9 染色质的高阶组织
3.10 DNA甲基化
3.11 RNAi和RNA介导的基因沉默
3.12 常染色质与异染色质的区别
3.13 从单细胞到多细胞系统
3.14 表观基因组参考图
3.15 扩展的基因概念和非编码RNA
3.16 Polycomb和Trithorax
3.17 X染色体失活和兼性异染色质
3.18 细胞命运重编程
3.19 癌症和表观遗传治疗
3.20 人类疾病的表观遗传因素
3.21 代谢和环境的表观遗传应答
3.22 表观遗传的遗传
3.23 表观遗传调控到底有什么功能？
3.24 表观遗传研究中涉及的重大问题
网络资源
第4章 组蛋白乙酰化的写入器和阅读器：结构、机制和抑制
4.1 组蛋白的写入器、擦除器和阅读器介绍
4.2 组蛋白乙酰转移酶
4.3 乙酰赖氨酸阅读器
4.4 展望
致谢
第5章 组蛋白乙酰化擦除器：组蛋白去乙酰化酶
5.1 引言
5.2 HDAC家族和分类：2个家族和4个类别
5.3 催化机理和结构
5.4 HDAC的底物
5.5 HDAC活性的调节
5.6 HDAC的生物学重要性
5.7 抑制剂
5.8 总结
第6章 DNA和组蛋白甲基化的结构和功能协调
6.1 组蛋白甲基化和去甲基化
6.2 DNA甲基化
6.3 DNA甲基化与组蛋白修饰之间的相互作用
6.4 总结
致谢
第7章 组蛋白表观遗传标记和DNA甲基化标记读取的结构解析
7.1 引言
7.2 通过PHD指和BAH模块读取Kme标记
7.3 通过单个Royal家族模块读取Kme标记
7.4 通过串联Royal家族模块读取Kme标记
7.5 通过组合和配对模块读取Kme标记
7.6 通过Tudor模块读取甲基化精氨酸标记
……
第8章 酿酒酵母的表观遗传学
第9章 粟酒裂殖酵母染色质状态的表观调控
第10章 粗糙脉孢菌：一个用于表观遗传学研究的模型系统
第11章 纤毛虫的表观遗传学
第12章 果蝇的花斑型位置效应、异染色质形成和基因沉默
第13章 植物的表观遗传调控
第14章 利用小鼠模型研究表观遗传学
第15章 哺乳动物中的DNA甲基化
第l6章 RNAi和异染色质组装
第17章 多梳蛋白家族介导的转录沉默
第l8章 一组Trithorax蛋白质调控基因表达
第19章 染色质的远程交互作用
第20章 组蛋白变体和表观遗传学
第21章 核小体重塑与表观遗传学
第22章 表观遗传信息的维持
第23章 秀丽隐杆线虫X染色体的调控
第24章 果蝇中的剂量补偿效应
第25章 哺乳动物中的剂量补偿效应
第26章 哺乳动物中基因组印记
第27章 生殖细胞系和多能干细胞
第28章 诱导多能性和表观遗传重编程
第29章 免疫的表观遗传调控
第30章 染色质的代谢信号
第31章 植物响应环境的表观遗传调控
第32章 组蛋白和DNA修饰是神经元发育和功能的调节因子
第33章 表观遗传学与人类疾病
第34章 癌症的表观遗传决定因素
第35章 组蛋白修饰与癌症
第36章 染色质的必要性：展望
附录1 网络资源
附录2 目前记录的组蛋白修饰的详细目录
索引