《医林绳墨》原系明代医官方谷为其门人弟子讲解医理的讲稿，后经其子方隅整理而成。作者宗《内经》、仲景学说，参考金元诸家之论，结合临床所得，不拘于成说而每多创见。特别是于每证之后，别列“治法主意”，综合说明本证的病理和治疗，以便于记忆。本次整理以明万历十二年初刻本为底本。

卷一
中风
伤风
中寒
伤寒
风寒
中暑附伤暑、冒暑及中热、注夏、暑风
湿
湿热
燥
火
疟
痢
卷二
痰
喘
咳嗽
霍乱
泄泻
呕哕吐
吞酸吐酸
嘈杂嗳气
卷三
气论
血论
汗
惊悸
怔忡
健忘
恍惚
虚损
痨瘵
眩晕
卷四
头痛附头风
心痛附胃脘痛
腹痛附小腹痛及腹中窄狭
胁痛
腰痛
牙痛
疝痛附木肾、阴痿、强中
脚气
关格
欬逆
卷五
脾胃
内伤
噎膈附反胃
格食格气
伤饮伤食
六郁附五郁
臌胀附中满、蛊胀、水肿、黄肿、面肿、足肿、肢肿、阴肿、囊肿、子肿、眼胞肿、儿肿
消渴附强中
白火丹黄疸痧
卷六
淋沥附癃闭
小便不利附白带、白浊
小便不禁附咳嗽遗尿
梦遗精滑附便浊
痿
痹附麻木不仁
厥
痓
癫狂
痫
卷七
耳
目
口
鼻附鼻酸、鼻梁痛
咽喉
舌
积聚
瘕瘕
痞块
秘结
恶寒发热
卷八
妇人调经论
崩中
带下
胎前
产后
室女月水不通
癍疹
痛风
历节风
痔漏附肠风
脱肛
疮疡
肿毒
校注后记