第一章 概论
第一节 作物表型概念
一、作物表型与表型组学
二、作物表型研究的发展潜力
第二节 作物表型数据
一、表型数据分类
二、表型数据获取方法
三、高通量作物表型组数据特点
第三节 作物表型数据管理发展现状与挑战
一、发展现状
二、大数据管理的挑战
参考文献
第二章 高通量作物表型组学研究前沿与数据需求
第一节 高通量作物表型组学与精准育种技术研究前沿分析
一、研究现状
二、发展态势及重大进展分析
三、未来展望
第二节 作物表型数据需求分析
一、表型数据管理应用现状
二、表型数据管理提升建议
参考文献
第三章 基于生命周期的作物表型数据管理研究
第一节 数据的生命周期
一、数据生命周期理论
二、作物表型数据生命周期模型
第二节 基于生命周期的育种数据管理
一、数据管理政策、标准
二、数据汇交与加工
三、数据长期保存
四、数据共享服务
参考文献
第四章 作物表型实验层级分解模型研究
第一节 育种实验层级分解方法研究
一、作物育种实验
二、层级分解方法
第二节 作物表型实验数据层级分解模型研究
一、算法研究
二、数据库设计
三、文档数据加工与分析
四、表型数据采集层级分解模型
参考文献
第五章 多源异构组学数据关联方法研究
第一节 作物组学数据特征
一、表型组学数据
二、基因组学数据
三、转录组学数据
四、代谢组学数据
第二节 多源异构多组学数据关联方法
一、多组学数据存储
二、多源组学数据通用元数据标准
三、元数据映射关系
四、多源异构组学数据融合方法
参考文献
第六章 基于本体的多组学数据集成技术研究
第一节 多组学数据本体网络
第二节 数据本体注释方法
一、SO注释方法
二、PATO注释方法
三、PO注释方法
四、GO注释方法
五、数据存储设计
第三节 关系推理
一、本体内关系推理
二、分级相关性关系推理
参考文献
第七章 数据共享协议研究
第一节 数据共享协议现状
一、共享协议在数据共享中的价值
二、现有共享协议基本情况
三、共享协议应用现状
四、现有许可证式共享协议适用性分析
第二节 作物表型科学数据的共享协议研究
一、协议设计
二、协议草拟
参考文献
结语和致谢
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