全书共25篇，收录60余种疾病和262首方剂，阐述的疾病以内科杂病为主，兼及外科、妇科、急救及饮食禁忌等。涵盖脏腑经络病、伤寒类疾病（如中风、血痹）、呼吸系统疾病（如肺痿、肺痈）、五脏积聚、痰饮、消渴、黄疸、妊娠病、产后病等杂症论治。全书以脏腑经络辨证为核心，结合病因病机分析，重点强调内科杂病的“病脉证治”，与《伤寒论》“六经病”辨证互为补充，对后世杂病治疗具有巨大的指导意义。

脏腑经络先后病脉证第一
痉湿喝病脉证治第二
百合狐惑阴阳毒病脉证治第三
疟病脉证并治第四
中风历节病脉证并治第五
血痹虚劳病脉证并治第六
肺痿肺痈咳嗽上气病脉证治第七
奔豚气病脉证治第八
胸痹心痛短气病脉证治第九
腹满寒疝宿食病脉证治第十
五脏风寒积聚病脉证并治第十一
痰饮咳嗽病脉证并治第十二
消渴小便不利淋病脉证并治第十三
水气病脉证并治第十四
黄疽病脉证并治第十五
惊悸吐衄下血胸满瘀血病脉证治第十六
呕吐哕下利病脉证治第十七
疮痈肠痈浸淫病脉证并治第十八
趺蹶手指臂肿转筋阴狐疝虻虫病脉证治第十九
妇人妊娠病脉证并治第二十
妇人产后病脉证治第二十一
妇人杂病脉证并治第二十二