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《国家安全机关行政执法程序规定》共7章140条，包括总则、防范指导、调查取证、征用补偿、行政处罚、期间与送达、附则。《国家安全机关办理刑事案件程序规定》共11章360条，包括总则，管辖，回避，律师参与刑事诉讼，证据，强制措施，立案、撤案，侦查，执行刑罚，特别程序，附则。上述两个规章文件是规范国家安全机关执法司法活动的重要依据，对依法打击危害国家安全违法犯罪活动、保障个人和组织合法权益、提升国家安全工作法治化水平，具有重要意义。

国家安全机关行政执法程序规定
第一章总则
第二章防范指导
第三章调查取证
第一节一般规定
第二节询问违法嫌疑人
第三节问询情况
第四节查验
第五节查阅、调取
第六节检查
第七节查封、扣押、冻结、先行登记保存
第八节辨认
第九节鉴定
第四章征用补偿
第五章行政处罚
第一节一般规定
第二节简易程序
第三节普通程序
第四节听证程序
第五节执行程序
第六章期间与送达
第七章附则

国家安全机关办理刑事案件程序规定
第一章总则
第二章管辖
第三章回避
第四章律师参与刑事诉讼
第五章证据
第六章强制措施
第一节拘传
第二节取保候审
第三节监视居住
第四节拘留
第五节逮捕
第六节羁押
第七节其他规定
第七章立案、撤案
第一节受案
第二节立案
第三节撤案
第八章侦查
第一节一般规定
第二节讯问犯罪嫌疑人
第三节询问证人、被害人
第四节勘验、检查
第五节搜查
第六节查封、扣押
第七节查询、冻结
第八节鉴定
第九节辨认
第十节技术侦查
第十一节通缉
第十二节侦查终结
第十三节补充侦查
第九章执行刑罚
第十章特别程序
第一节未成年人刑事案件诉讼程序
第二节犯罪嫌疑人逃匿、死亡案件违法所得的没收程序
第十一章附则