本书第一章探索文化原型基因是以“造物设计”作为推动文明进程的原动力，以造物设计解读人的精神信仰、国家政治秩序和社会伦理道德。
第二章通过“玄黄”二元中隐喻的中国空间地理意象，揭示出人们对意象图示的认知决定了中国传统造物智慧的双向式思维的超越。
第三章通过鲧禹治水创世神话，探索治水、建造和伦理的关系。
第四章通过对《易经》“龙战于野，其血玄黄”的分析，解读其隐喻的自然辩证关系，理解其中的造物设计与原始道德，而其核心在于演绎天地神秘的意象，以玄黄为色彩二元表征下的玉石象征，比拟天地阴阳思维原型所构筑的伦理指向，延递“立象以尽意”中的中华器物文化精神，在当代大力推崇传统文化之契机中，挖掘文化大传统时代的造物价值。
第五章将神话思维与神圣建筑进行原型联系，沿着“建木”神话推溯人类追求“摩天大楼”式建筑形态的原型思维。
第六、七、八章对建筑原型精神进行了分析论证，使其形态植入当代设计。
第九章以原型基因为视角，探讨汉字原型对中国城市变迁的影响，研究隐喻在城市建筑中的与汉字有关的联系，从不同角度分析城市发展变迁的历史原因，由此引出传统城市设计理念在现代城市规划理念中的应用实践，以及反思当代城市规划中存在的问题。
第十章探索了农耕背景下的楼阁式高塔建筑的演变过程。从古代文献、文字原型、古代实物以及民间故事四个方面分析了自然环境、农耕文化与长江流域楼阁式佛塔建筑之间的关系。同时，探讨了当代楼阁式佛塔建筑形态的发展与演变。最后得出了农耕文化与佛塔建筑形态的关系。
第十一章尝试结合文学经典解读建筑空间，从中国四大名著之一的《红楼梦》中隐喻的文化原型入手，选择作品中关键人物的三处居住空间“怡红院、潇湘馆、蘅芜苑”的室内外环境进行分析，探索成熟表现在中国文学作品中的原型意象。通过大观园中主要人物宝、黛、钗三人的住所分析居住者的性格及审美，既从总体上结合现代建筑理念对三座建筑所具备的建筑特色进行概括，又从建筑与人物的关系出发，解读建筑主人的性格特征与建筑空间之间的意象关系。
第十二章和第十三章是以西江苗寨和蒙古穹庐式建筑作为原型进行分析。
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